Из первого сезона запомнились серии: 1) про Йоду (она же первая), 2) про Пло Куна и клонов, застрявших в спасательной капсуле, 3) про аванпост и клонов-героев (помните такую серию), по моему там впервые и проявились различные черты индивидуальности клонов.
Так же забавно смотрится серия про Джа-Джа-Джедая)
Остальные серии в основном среднего уровня - особого восторга не вызывают, но и плеваться с них не хочется.
Из второго сезона могу выделить:
1) Первая часть оккупации Геонозиса (ух, наконец то видим именно ВОЙНУ клонов, прям ностальгия по старому доброму II эп и игре Репаблик Коммандо),
2) Серия про спасение джедая. (Нелепо правда что спасённым оказался Итт Кот, да и гораздо забавнее получилось бы, если бы его в последний момент убили:) честно говоря надеялся на такой исход)
3) Отдельную благодарность сценаристам за клона-дезертира (думаю эта встреча в будущем сильно повлияет на какие то решения Рекса), но только за саму эту идею, в остальном серия - бред.

Остальные серии в основном ниже среднего уровня - смотрятся либо скучно, либо вызывают негодование типа "ну не было такого, опять Филони всё переврал".
PS Всё сказанное - имхо.